《新世纪福音战士》电影版第1部。分为“DEATH篇（死亡篇）”与“REBIRTH篇（新生篇）”两个部分。“死亡篇”以原TV版动画第1集到第24集的内容为基础，从新剪辑了一个总结篇。“新生篇”内容承接第24集内容：　　第十七使徒被消灭后，SEELE向NERV下达命令，要EVA初号机负责履行“人类补完筹划”。然而碇元度不认同SEELE的做法，拒绝履行。SEELE认定这是一种变节的行为，决定把NERV彻底消灭。　　凌晨时分，NERV本部忽然遭到来自战略自卫队的袭击，他们对NERV的人员进行了惨无人道的大屠戮。为了掩护驾驶员，葛城美里命令把精力崩溃的明日香送上二号机，并放在湖底的深处，自已就亲自去救碇真嗣 。但此时的碇真嗣已经处在精力崩溃的边缘。