风和日丽的一天,铃木财团巨资营建的铃木塔举办了隆重的揭幕典礼。柯南(高山南 配音)和好朋友们自然受邀参观。谁知一名旅客忽然被远处建筑发射来的子弹狙击身亡,柯南锁定凶手果断展开追击,然而对方胆大非常,公然炸毁拦阻他的警车,在重重包抄中脱身而去。在此之后,FBI和日本警方构成结合调查总部,经朱蒂?斯泰琳(一城美由希 配音)介绍得知,嫌疑人很可能是原美国海豹突击队狙击手蒂莫西·亨特。战功显赫的亨特曾经获得过银星勋章,但是后来被战友指控违背交战原则,射杀了手无寸铁的布衣,此后他更在战场上遭遇影响终生的创痛,人生也彻底跌入低谷。此番他以神秘狙击手的出现,显然是想想那些毁灭了他的人生的人们复仇。
狙击事件接连而起,全东京陷入莫大的惊恐之中……