为了成为合格的神奇宝贝练习师，小智（松本梨香 配音）、天桐（宫野真 配音）、艾莉丝（悠木碧 配音）带着各自的小伙伴继续在世界各地观光。此次他们来到了俏丽的山中小镇艾茵多奥克参加神奇宝贝的竞赛，在竞赛的时候，小智多次获得一个神秘的小家伙的帮助。他的反常举措引起了当地的俏丽女孩卡莉塔的留意，最终众人发现，那个帮助了小智的家伙就是传说中拥有神奇力量的神奇宝贝比克提尼（水树奈奈 配音）。 　　早在一千多年前，艾茵多奥克所在的土地上有一个俏丽富裕的大地之乡，可是两个王子的争斗摧毁了这个国家的安静。老国王借助比克提尼的力量暂时稳定住了龙脉，而大地之乡则从此衰败。作为古国的后裔，卡莉塔的哥哥德雷多（つるの剛士 配音）决定依附比克提尼重建大地之乡……